Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms