Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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FarsaQ8C0C7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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