Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms