Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fbxo38Q8BMI0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxo38Q8BMI0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms