Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nop53Q8BK35 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop53Q8BK35 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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