Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atg4dQ8BGV9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atg4dQ8BGV9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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