Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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