Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htatsf1Q8BGC0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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