Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrsam1Q80ZI6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrsam1Q80ZI6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrsam1Q80ZI6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrsam1Q80ZI6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrsam1Q80ZI6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrsam1Q80ZI6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrsam1Q80ZI6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms