Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TnnQ80Z71 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms