Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Ttc28Q80XJ3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ttc28Q80XJ3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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