Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbed4Q80WQ9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbed4Q80WQ9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms