Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Avl9Q80U56 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Avl9Q80U56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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