Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec16aQ80U30 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clec16aQ80U30 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms