Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv1Q704Y3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms