Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Herc4Q6PAV2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms