Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms