Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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