Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrcc1Q69ZB0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms