Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slain1Q68FF7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slain1Q68FF7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slain1Q68FF7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slain1Q68FF7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slain1Q68FF7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms