Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rbm38Q62176 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rbm38Q62176 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rbm38Q62176 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rbm38Q62176 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rbm38Q62176 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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