Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prkd1Q62101 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prkd1Q62101 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Prkd1Q62101 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prkd1Q62101 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms