Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Odf1Q61999 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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