Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msi1Q61474 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms