Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxd4Q60688 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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