Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5XFZ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms