Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Utp18Q5SSI6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms