Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms