Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f8Q58FA4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f8Q58FA4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms