Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnl1Q52KE7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms