Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tigd5Q499M4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tigd5Q499M4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms