Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim26Q3V460 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms