Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms