Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KhsrpQ3U0V1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KhsrpQ3U0V1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms