Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms