Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm21440Q3TTD8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21440Q3TTD8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms