Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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