Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc102aQ3TMW1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms