Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca4Q3TKT4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms