Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp39Q3TIX9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp39Q3TIX9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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