Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbp8Q2V6D6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gbp8Q2V6D6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gbp8Q2V6D6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbp8Q2V6D6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms