Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cers3Q1A3B0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms