Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms