Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrriq1Q0P5X1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms