Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TrioQ0KL02 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms