Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc4Q08624 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxc4Q08624 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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