Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tgm3Q08189 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms