Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms