Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col9a2Q07643 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms