Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smarcad1Q04692 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms